29 ноября 2001 г. комиссия МАП признала в действиях правительства Москвы и мэра Москвы нарушение статей №12 и №13 федерального закона "О защите конкуренции на рынке финансовых услуг". Эти действия выразились в том, что Банк Москвы, в котором контрольный пакет акций принадлежит правительству Москвы, был определен в качестве основного кредитного института по обслуживанию бюджетных счетов в Москве, в то время как Бюджетный кодекс РФ устанавливает казначейское, а не банковское исполнение бюджетов РФ всех уровней.
Этими действиями, по мнению МАП, были созданы необоснованно благоприятные условия отдельной финансовой организации - Банку Москвы, а само привлечение этой финансовой организации к осуществлению операций с бюджетными средствами было осуществлено не на конкурсной основе, что противоречит указанным нормам федерального закона "О защите конкуренции на рынке финансовых услуг".
Решение комиссии было обжаловано мэром и правительством Москвы в арбитражном суде Москвы, который 7 февраля 2002 г. признал решение комиссии МАП незаконным. В свою очередь, МАП обратилось с кассационной жалобой на решение суда первой инстанции, однако кассационная инстанция Федерального арбитражного суда Московского округа оставила его в силе. Теперь МАП намерено отстаивать свою позицию в Высшем арбитражном суде РФ.